Tras dos años en el Autocid Ford Burgos ( 05/07 ) logrando el ascenso a LEB Oro en la 2ª temporada el jugador recaló en el equipo gaditano de Los Barrios la temporada 07/08, aunque una inoportuna lesión le mantuvo apartado de las canchas una buena parte de la misma, recuperándose sólo al final para disputar el play off. En los dos años que estuvo en el Autocid realizó dos buenas campañas promediando 10.7 ptos en cada una de ellas y con buenos porcentajes, especialmente desde la línea de tiros libres ( 87%). Juanmi Morales volverá al equipo burgalés a aportar su experiencia en la categoría, siendo un jugador que es capaz de aportar muchas cosas positivas en ambos lados del campo: muy aplicado en defensa y capaz de sumar puntos en ataque gracias a su capacidad para correr el contraataque y sus penetraciones a canasta.